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| Taxon | Collector | Date | Country | State/Province | Locality | Type Status | Barcode | ||
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| Piper dolichostylum Callejas & Betancur | J. L. Fernández Alonso 11009 | 20 Apr 1994-01 May 1994 | Colombia | Putumayo | Municipio Mocoa, corregimiento de San… | isotype | 00277627 |
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| Salvia gachantivana Fern.Alonso | J. L. Fernández Alonso 8217 | 12 Dec 1989 | Colombia | Boyacá | Carretera de Villa de Leyva… | isotype | 00039327 |
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| Sticherus chocoensis J.Gonzales | J. L. Fernández Alonso 8515 | 05 Dec 1990 | Colombia | Chocó | Istmina, Pepé, cerca del Río… | holotype | 804250 |
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| Myrcia guianensis (Aubl.) DC. | J. L. Fernández Alonso 4814 | 5 July 1992 | Puerto Rico | Cabo Rojo | Sierra Bermeja, upper slopes and… | — | 843518 |
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| Myrcia guianensis (Aubl.) DC. | J. L. Fernández Alonso 4638 | 6 June 1992 | Puerto Rico | Yauco | Susúa Forest Reserve. Trail N… | — | 843510 |
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| Polystachya foliosa (Hook.) Rchb.f. | J. L. Fernández Alonso 417 | 07 Sep 1987 - 11 Sep 1987 | Colombia | Valle del Cauca | Isla de Gorgona, cercanas a… | — | 951818 |
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| Clidemia capitellata (Bonpl.) D.Don | J. L. Fernández Alonso 7234 | 08 Aug 1987 | Colombia | Santander | Entre Olival y Vadorreal. | — | 01129969 |
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| Phragmotheca lemniscata Fern.Alonso | J. L. Fernández Alonso 8501 | 04 Dec 1990 | Colombia | Chocó | Condoto, Playa de Santa Rosa | isotype | 1104995 |
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| Senna | J. L. Fernández Alonso 5553 | 22 Oct 1995 | Colombia | Meta | Mpio. San Luis de Cubarral,… | — | 1731423 |
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| Salvia guacana Fern.Alonso | J. L. Fernández Alonso 28110 | 27 Jun 2009 | Colombia | Santander | Vía Curos-Málaga, antes el desvio… | paratype | 02256174 |
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| Salvia guaneorum Fern.Alonso | J. L. Fernández Alonso 28169A | 28 Jun 2009 | Colombia | Santander | Vía San Andrés--Molagavita | isotype | 02256175 |
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| Cleome parviflora Kunth | J. L. Fernández Alonso 5685 | 13 Mar 1986 | Colombia | Meta | Carretera Villavicencio--Puerto López, Río Negrito | — | 02361373 |
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| Gaultheria lanigera var. rufolanata (Sleumer) Luteyn | J. L. Fernández Alonso 6163 | — | Colombia | Boyacá | Paramo de la Rusia, límite… | — | 02528216 |
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| Pernettya prostrata (Cav.) DC. | J. L. Fernández Alonso 15586 | May 21/98 | Colombia | Cundinamarca | Villapinzón, de Villapinzón a Umbita,… | — | 2605120 |
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| Vaccinium corymbodendron Dunal | J. L. Fernández Alonso 16885 | 17 Nov 1998 | Colombia | Cundinamarca | Mpio. Chocontá. Desvio Sisga-Chocontá, en… | — | 2634864 |
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| Psammisia | J. L. Fernández Alonso 11760 | 01 Nov 1994 | Colombia | Santander | Mun. de Toledo, 17-19 km… | — | 2635947 |
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| Aragoa corrugatifolia Fern.Alonso | J. L. Fernández Alonso 7754 | 10 Nov 1987 | Colombia | Cundinamarca | Paramo de Sumapaz, Despues de… | paratype | 02286667 |
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| Miconia salicifolia (Bonpl. ex Naudin) Naudin | J. L. Fernández Alonso 6310 | 17 Apr 1986 | Colombia | Distrito Capital | Páramo de Chisacá. Cercanias de… | — | 3368672 |
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| Orchidaceae | J. L. Fernández Alonso 8430 | 02 Dec 1990 | Colombia | Chocó | Istmina, carretera panamericana cerca de… | — | 01392798 |
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| Salpichlaena volubilis (Kaulf.) J.Sm. | J. L. Fernández Alonso 7454 | 10 Sep 1987 - 14 Sep 1987 | Colombia | — | Depto. del Valle. Isla de… | — | 4179556 |
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| Gaultheria rigida Kunth | J. L. Fernández Alonso JLF 14165 | 12 May 96 | Colombia | Boyacá | Arcabuco Mun. Vía Arcabuco-Villa de… | — | 2528640 |
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| Macleania rupestris (Kunth) A.C.Sm. | J. L. Fernández Alonso JLF 14153 | 11 May 96 | Colombia | Boyacá | Arcabuco Mun. Vereda Peñas Blancas,… | — | 2603726 |
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| Gaultheria erecta Vent. | J. L. Fernández Alonso JLF 14119 | 11 May 96 | Colombia | Boyacá | Arcabuco Mun. Vereda Peñas Blancas,… | — | 2527029 |
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| Gaultheria lanigera var. rufolanata (Sleumer) Luteyn | J. L. Fernández Alonso 6163 | 07 May 1986 | Colombia | Santander | Charalá Mun. Límite entre los… | — | 02528215 |
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| Cyathea | J. L. Fernández Alonso 6073 | 6 May 1986 | Colombia | Santander | Charala Mun. Municipio de Virolin | — | 02508821 |
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