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| Taxon | Collector | Date | Country | State/Province | Locality | Type Status | Barcode | ||
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| Taphrina populina Fr. | F. X. R. von Höhnel s.n. | XIII 1874 | Austria | — | Moosbrunn et Marienthal | — | 2775069 |
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| Fomes velutinus Bres. | F. X. R. von Höhnel s.n. | 1878 | Indonesia | — | Java, Tjibodas | lectotype | 00985680 |
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| Stereum hirsutum (Willd.:Fr.) Gray | F. X. R. von Höhnel s.n. | 1897 | Spain | Islas Canarias | Gran Canaria. Sardina | — | 1995697 |
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| Podofomes corrugis (Fr.) Pouzar | F. X. R. von Höhnel s.n. | 1898 | Austria | — | — | 01976585 |
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| Eurotium repens de Bary | F. X. R. von Höhnel s.n. | Aug 1901 | Germany | — | "Germania, Stiria: ad urbem Judenburg" | — | 2935178 |
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| Taphrina crataegi Sadeb. | F. X. R. von Höhnel T454 | May 1904 | Austria | — | Hühnerberg bei Baden im Wiener… | — | 286745 | ||
| Taphrina crataegi Sadeb. | F. X. R. von Höhnel A. J. Mix Taphrina T-454 | May 1904 | Austria | — | Hühnerberg near Baden in Wiener… | — | 02226005 | ||
| Crocicreas coronatum (Bull. ex Mérat) S.E.Carp. | F. X. R. von Höhnel s.n. | 24 Sep 1904 | Austria | — | Wiener-Wald | — | 3418319 |
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| Ophionectria ambigua Höhn. | F. X. R. von Höhnel | Jul 1905 | Austria | — | Nordhange des Hocheck bei Altenmarkl.… | isolectotype | 01013397 |
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| Podosphaera myrtillina Kunze | F. X. R. von Höhnel s.n. | m. Sept. 1905 | Germany | — | Germania, Austria inf.: in pratis… | — | 2943372 |
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| Helotium obconicum Höhn. | F. X. R. von Höhnel s.n. | Aug 1907 | Indonesia | Jawa Barat | Java. Tjibodas | type | 01179442 |
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| Bisporella citrina (Batsch) Korf & S.E.Carp. | F. X. R. von Höhnel A5361 | Aug 1907 | Indonesia | Jawa Barat | Java. Tjibodas | — | 3416988 |
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| Trametes parvula Bres. | F. X. R. von Höhnel 45 | 1908 | Indonesia | — | Java. Tjiboda | possible type | 00705050 |
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| Hypocrella cretacea Höhn. | F. X. R. von Höhnel s.n. | 1908 | Indonesia | — | Java, Tjibodas | probable type | 00921726 |
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| Hypomyces javanicus Höhn. | F. X. R. von Höhnel s.n. | 1908 | Indonesia | — | urwald von Tjibodas anf Java. | type | 00967718 |
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| Asterocalyx mirabilis Höhn. | F. X. R. von Höhnel s.n. | 1908 | Indonesia | Jawa Barat | Java. near Tjibodas | type | 00915006 |
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| Phialea panici Höhn. | F. X. R. von Höhnel s.n. | 1908 | Indonesia | Jawa Barat | Java. Cibodas | holotype | 01168098 |
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| Trichaptum durum (Jungh.) Corner | F. X. R. von Höhnel s.n. | 1908 | Indonesia | — | Java | — | 1771810 |
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| Crocicreas coronatum (Bull. ex Mérat) S.E.Carp. | F. X. R. von Höhnel A5326 | 01 Oct 1909 | Austria | — | Wiener-Wald | — | 3418318 |
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| Crocicreas coronatum (Bull. ex Mérat) S.E.Carp. | F. X. R. von Höhnel A5326 | 01 Sep 1912 | Austria | — | Wiener-Wald | — | 3418316 |
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| Psilocybe montana (Pers.:Fr.) P.Kumm. | F. X. R. von Höhnel s.n. | Mar | Austria | Lower Austria | Niederösterreich. in monte prope Kritzendorf… | — | 01797150 | ||
| Taphrina populina Fr. | F. X. R. von Höhnel A. J. Mix Taphrina T-321 | Jun | Austria | Lower Austria | Niederösterreich. between Moosbrunn and Marienthal | — | 02234319 | ||
| Taphrina populina Fr. | F. X. R. von Höhnel T321 | June | Austria | — | Between Moosbrun and Marienthal, Austria… | — | 292166 | ||
| Dasyscyphus agassizii (Berk. & M.A.Curtis) Sacc. | F. X. R. von Höhnel s.n. | — | Austria | — | Radstatt | — | 1481711 |
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| Bisporella pallescens (Pers.) S.E.Carp. & Korf | F. X. R. von Höhnel s.n. | s.d. | Czech Republic | — | Rosenberg | — | 1693298 |
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