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| Taxon | Collector | Date | Country | State/Province | Locality | Type Status | Barcode | ||
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| Puccinia polygoni-amphibii Pers. | F. Fautrey s.n. | Oct 1895 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Epoisses. | — | 3413592 |
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| Ramularia curvula Fautrey | F. Fautrey s.n. | summer 1894 | — | — | syntype | 01042935 |
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| Ramularia mercurialis-perennis Roum. | F. Fautrey s.n. | automne 1889 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Bois des Roches | syntype | 01042961 |
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| Rhabdospora parasitica Kuntze | F. Fautrey s.n. | Sep 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Jardin de Noidan… | syntype | 03665430 |
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| Rhizodiscina lignyota (Fr.) Hafellner | F. Fautrey s.n. | Dec 1897 | — | — | [No locality information included with… | — | 2979594 |
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| Rhizodiscina lignyota (Fr.) Hafellner | F. Fautrey s.n. | Dec 1897 | — | — | [No locality information included with… | — | 2979599 |
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| Rigidoporus undatus (Pers.:Fr.) Donk | F. Fautrey s.n. | Aug 1893 | France | — | — | 01969941 |
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| Rigidoporus undatus (Pers.:Fr.) Donk | F. Fautrey s.n. | Aug 1893 | — | — | — | 01969942 |
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| Saccharomyces roseus L.Engel | F. Fautrey s.n. | s.d. | — | — | "Rec. el. Macè" | — | 02768258 |
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| Saccharomyces roseus L.Engel | F. Fautrey s.n. | — | — | — | "Rec. el. Macè" | — | 02768259 |
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| Schizophyllum commune Fr. | F. Fautrey s.n. | May 1897 | — | — | — | 1985593 |
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| Schizophyllum commune Fr. | F. Fautrey s.n. | May 1897 | — | — | — | 1985597 |
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| Septoria stellariae-nemorosae Roum. | F. Fautrey s.n. | Jun 1893 | France | — | Dans les jardins | — | 3663152 |
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| Septoria stellariae-nemorosae Roum. | F. Fautrey s.n. | Jun 1893 | France | — | Dans les jardins | — | 3663153 |
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| Sistotremastrum suecicum Litsch. ex J.Erikss. | F. Fautrey s.n. | Mar 1896 | — | — | — | 1944258 |
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| Sistotremastrum suecicum Litsch. ex J.Erikss. | F. Fautrey s.n. | Mar 1896 | — | — | — | 1944259 |
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| Solenia anomala (Pers.) Fuckel | F. Fautrey s.n. | Feb 1897 | — | — | — | 1985967 |
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| Sphaerella cruciatae Lambotte & Fautrey | F. Fautrey s.n. | Apr 1895 | France | — | Côte-d'Or | syntype | 03667121 |
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| Sphaerella cruciatae Lambotte & Fautrey | F. Fautrey s.n. | Apr 1895 | France | — | Côte-d'Or | syntype | 03667122 |
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| Sphaerella menthae Lambotte & Fautrey | F. Fautrey s.n. | May 1895 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Précy. | syntype | 03667815 |
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| Sphaerella menthae Lambotte & Fautrey | F. Fautrey s.n. | May 1895 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Précy. | syntype | 03667814 |
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| Sphaerella napicola Fautrey | F. Fautrey s.n. | Sep 1889 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). | isotype | 03667890 |
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| Sphaerella napicola Fautrey | F. Fautrey s.n. | Sep 1889 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). | isotype | 03667891 |
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| Sphaerella parasitica Fautrey | F. Fautrey s.n. | s.d. | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Noidan. | isotype | 03667965 |
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| Sphaerella pinicola Fautrey | F. Fautrey s.n. | Sep 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Environs d'Epoisses. | syntype | 03666025 |
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