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| Taxon | Collector | Date | Country | State/Province | Locality | Type Status | Barcode | ||
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| Diaporthe inaequalis (Curr.) Nitschke | F. Fautrey 7216 | Jul 1869 | — | — | — | 2930070 |
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| Gnomonia leptostyla (Fr.) Ces. & De Not. | F. Fautrey s.n. | Dec 1888 | France | — | Cote-d'Or, Charny | — | 2931260 |
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| Gnomonia setacea (Pers.) Ces. & De Not. | F. Fautrey s.n. | Janvier [January] 1889 | — | — | Epi et hypophylle, Noidan (Côte-d'Or) | — | 2931419 |
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| Hypospila quercina Fr. | F. Fautrey s.n. | Jan 1889 | France | — | Foret de Charny (Cote d'Or) | — | 2931734 |
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| Laestadia cookeana (Auersw.) Sacc. | F. Fautrey s.n. | Apr 1889 | France | — | Forêt de Charny Côte-d'Or | — | 02931766 |
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| Melanomma vinosum Fautrey | F. Fautrey s.n. | May 1889 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). | not a type | 01047226 |
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| Melanomma vinosum Fautrey | F. Fautrey s.n. | May 1889 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). | — | 01047227 |
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| Dinemasporium epixylon Fautrey | F. Fautrey s.n. | May 1889 | France | — | Noidan (Côte-d'Or) | isotype | 03633987 |
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| Lophidium diminuens (Pers.) Ces. & De Not. | F. Fautrey s.n. | May 1889 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Pont de Charny… | — | 04681265 | ||
| Nectria cucurbitula (Tode) Fr. | F. Fautrey s.n. | Jun 1889 | France | — | Noidan (Côte-d'Or) | — | 2956581 |
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| Diaporthe inaequalis (Curr.) Nitschke | F. Fautrey 5231 | Jul 1889 | France | — | Arsy (Cote d'Or) | — | 2930060 |
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| Diaporthe mazzantioides Sacc. & Speg. | F. Fautrey s.n. | Jul 1889 | France | — | Noidan, Côte-d'Or | — | 02930227 |
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| Pseudovalsa aucta (Berk. & Broome) Sacc. | F. Fautrey s.n. | Jul 1889 | — | — | — | 02932601 |
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| Fenestella princeps Tul. & C.Tul. | F. Fautrey s.n. | Jul 1889 | — | — | Aisy (Côte-d'Or) | — | 2977513 |
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| Pezizella clematidis Fautrey | F. Fautrey s.n. | Jul 1889 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). environs de Noidan | type | 01168135 |
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| Gloeosporium vincetoxici Fautrey | F. Fautrey s.n. | Jul 1889 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Friches de Charny | type | 01087012 |
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| Lophiotrema semiliberum (Desm.) Sacc. | F. Fautrey s.n. | Jul 1889 | France | — | Noidan (Isère). | — | 04681368 | ||
| Thyridaria incrustans Sacc. | F. Fautrey s.n. | Aug 1889 | France | — | Promenade à Noidan (Côte-d'Or). | — | 02978647 |
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| Didymosphaeria futilis (Berk. & Broome) Rehm | F. Fautrey s.n. | Aug 1889 | France | — | Charny. Côte-d'Or. | — | 2977204 |
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| Sphaerella napicola Fautrey | F. Fautrey s.n. | Sep 1889 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). | isotype | 03667890 |
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| Sphaerella napicola Fautrey | F. Fautrey s.n. | Sep 1889 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). | isotype | 03667891 |
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| Entyloma eryngii (Corda) de Bary | F. Fautrey s.n. | Oct 1889 | — | — | Environ de Précy (Côte-d'Or) | — | 3022630 |
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| Ramularia mercurialis-perennis Roum. | F. Fautrey s.n. | automne 1889 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Bois des Roches | syntype | 01042961 |
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| Haplographium penicillioides Roum. | F. Fautrey s.n. | autumn 1889 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Forêt de Charny | type | 00945974 |
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| Fenestella princeps Tul. & C.Tul. | F. Fautrey s.n. | 19 Jan 1890 | — | — | Noidan (Côte-d'Or) | — | 2977512 |
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| Didymosphaeria epidermidis (Fr.) Fuckel | F. Fautrey s.n. | Jan 1890 | France | — | Beaune (Côte-d'Or). | — | 2977143 |
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| Diplodia pterophila Roum. | F. Fautrey s.n. | Feb 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). | isotype | 01097204 |
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| Nectria auricoma (Wallr.) Mont. | F. Fautrey s.n. | Feb 1890 | France | — | Noidan (Côte-d'Or). | — | 02955027 |
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| Diplodina amaranthi Roum. | F. Fautrey s.n. | Feb 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Jardin de Noidan | type | 01097216 |
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| Metasphaeria lonicerae Fautrey | F. Fautrey 25 | 17 Feb 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). | syntype | 01103025 |
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| Metasphaeria lonicerae Fautrey | F. Fautrey s.n. | 17 Feb 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). | syntype | 01103024 |
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| Laestadia fraxini Fautrey | F. Fautrey s.n. | Mar 1890 | France | — | Foret de Charny (Cote-d'Or) | — | 02931772 |
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| Melanomma brachythele (Berk. & Broome) Sacc. | F. Fautrey s.n. | Mar 1890 | — | — | Sur vieux bois de Lierre.… | — | 02977988 |
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| Diaporthe conjuncta (Nees) Fuckel | F. Fautrey 5351 | 27 Mar 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Environ de Precy… | — | 2929708 |
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| Gnomonia setacea (Pers.) Ces. & De Not. | F. Fautrey s.n. | Apr 1890 | — | — | Noidan (Côte-d'Or) | — | 2931439 |
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| Gloeosporium viciae Fautrey & Roum. | F. Fautrey s.n. | Apr 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). | type | 01087010 |
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| Diaporthe occulta (Fuckel) Nitschke | F. Fautrey 6427 | 05 Apr 1890 | France | — | Foret de Charny (Cote-d'Or) | — | 2930289 |
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| Lophiotrema semiliberum (Desm.) Sacc. | F. Fautrey s.n. | 08 Apr 1890 | Côte d'Ivoire | — | Rives du Serein. | — | 04681365 | ||
| Melanomma fuscidulum Sacc. | F. Fautrey s.n. | 24 Apr 1890 | — | — | Château de Charny (Côte-d'Or) | — | 02978022 |
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| Laestadia vincetoxici Fautrey | F. Fautrey s.n. | May 1890 | France | — | Friches de Charny (Côte-d'Or) | — | 02931821 |
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| Ustilago longissima (J.Sowerby) Tul. | F. Fautrey s.n. | 26 May 1890 | France | — | Dans une mare á Montagnerot… | — | 3016134 |
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| Cercospora primulae Fautrey | F. Fautrey s.n. | 01 Jun 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Bois des Roches | type | 00937131 |
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| Metasphaeria sparganii Fautrey | F. Fautrey s.n. | Jun 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Rivière de l'Armançon… | syntype | 03665346 |
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| Marasmiellus ramealis (Bull.) Singer | F. Fautrey s.n. | Jul 1890 | France | — | Precy, Cote-d'Or | — | 02755900 |
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| Ustilago hypodytes (Schltdl.) Fr. | F. Fautrey s.n. | Jul 1890 | France | — | Jardin de Noidan (Côte-d'Or) | — | 3017896 |
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| Erysiphe martii Lév. | F. Fautrey s.n. | Jul 1890 | France | — | Précy (Còte-d'Or) | — | 2938953 |
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| Melanomma fuscidulum Sacc. | F. Fautrey s.n. | Jul 1890 | France | — | Noidan (Côte-d'Or) | — | 2978021 |
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| Thelephora palmata (Scop.) Fr. | F. Fautrey s.n. | 01 Aug 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Sapinière près d'Epoisses. | — | 01991867 |
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| Laestadia cylindrasca (Sacc. & Speg.) Sacc. | F. Fautrey s.n. | 08 Aug 1890 | France | — | Et Precy (Cote-d'Or) | — | 02931770 |
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| Cyathus olla (Batsch) Pers. | F. Fautrey s.n. | 30 Aug 1890 | France | — | d'Epoisses, Cote-d'Or | — | 1967642 |
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| Sphaerella pinicola Fautrey | F. Fautrey s.n. | Sep 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Environs d'Epoisses. | syntype | 03666025 |
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| Ascochyta cucumis Fautrey & Roum. | F. Fautrey s.n. | Sep 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Jardin de Noidan | isotype | 01097087 |
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| Rhabdospora parasitica Kuntze | F. Fautrey s.n. | Sep 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Jardin de Noidan… | syntype | 03665430 |
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| Lophiostoma arundinis (Pers.) Ces. & De Not. | F. Fautrey s.n. | Sep 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Rives de l'Armançon. (Côte-d'Or). | — | 04681245 | ||
| Gnomoniella nervisequa (Wallr.) Sacc. | F. Fautrey s.n. | Oct 1890 | — | — | Sur les feuilles de Charme.… | — | 02931675 |
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| Plasmopara umbelliferarum Unger | F. Fautrey s.n. | Oct 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Bords de l'Armancon | — | 2759433 |
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| Helotium amoenum Fautrey | F. Fautrey s.n. | Oct 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). | possible isotype | 01169351 |
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| Diaporthe strumella (Fr.) Fuckel | F. Fautrey s.n. | 15 Oct 1890 | France | — | Cote-d'Or, Fontangy | — | 2930738 |
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| Diaporthe leiphaemia (Fr.) Sacc. | F. Fautrey s.n. | Nov 1890 | France | — | Au bois des Roches, a… | — | 2930139 |
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| Valsa sepincola Fuckel | F. Fautrey s.n. | Nov 1890 | France | — | "Wood of rocks", à Noidan… | — | 02934491 |
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| Valsa sordida Nitschke | F. Fautrey s.n. | Nov 1890 | France | — | Noidan (Côte-d'Or) | — | 2934526 |
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| Melanomma disjectum H.Karst. | F. Fautrey s.n. | Nov 1890 | — | — | Noidan (Côte-d'Or) | — | 02978005 |
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| Laestadia carpinea (Fr.) Sacc. | F. Fautrey s.n. | Dec 1890 | France | — | Noidan (Côte-d'Or) | — | 2931759 |
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| Melanomma roumegueri (P.Karst.) Sacc. | F. Fautrey s.n. | Hiver 1890 | — | — | Noidan (Côte-d'Or) | — | 02978170 |
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| Diaporthe fibrosa (Pers.) Fuckel | F. Fautrey | Ete 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Environs d'Epoises (Cote-d'Or) | — | 2929997 |
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| Leptosphaeria lathyri Fautrey | F. Fautrey s.n. | 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). | isotype | 00927733 |
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| Patellaria atrata (Hedw.) Fr. | F. Fautrey s.n. | Été 1890. | France | — | Environs de Noidan (Côte-d'Or). | — | 2979454 |
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| Nectriella artemisiae Fautrey | F. Fautrey Summer1890 | 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). | isotype | 01013304 |
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| Sphaerotheca castagnei Lév. | F. Fautrey s.n. | Automne 1890 | France | — | Jardin de Noidan (Côte-d'Or) | — | 2944172 |
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| Phellinus conchatus (Pers.:Fr.) Quél. | F. Fautrey s.n. | 1890 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). Noidan. | — | 3024589 |
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| Diaporthe syngenesia (Fr.) Fuckel | F. Fautrey s.n. | Feb 1891 | France | — | Forêt de Clamerey (Côte -… | — | 2930792 |
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| Diplodina clematidina Fautrey & Roum. | F. Fautrey s.n. | Mar 1891 | France | Bourgogne-Franche-Comté | Côte-d'Or (Dept.). | type | 01097217 |
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| Diaporthe juglandina (Fuckel) Nitschke | F. Fautrey s.n. | Apr 1891 | France | — | Chateau de Charney, Cote-d'Or | — | 2930109 |
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| Diaporthe juglandina (Fuckel) Nitschke | F. Fautrey s.n. | Apr 1891 | France | — | Chateau de Charny, Cote-d'Or | — | 2930110 |
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| Diaporthe scabra Nitschke | F. Fautrey s.n. | Apr 1891 | France | — | Côte-d'Or | — | 02930640 |
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